Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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