Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf1bP97358 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf1bP97358 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf1bP97358 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf1bP97358 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf1bP97358 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf1bP97358 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Taf1bP97358 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Taf1bP97358 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms