Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx1P80205 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms