Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tp53bp1P70399 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Tp53bp1P70399 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Tp53bp1P70399 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Tp53bp1P70399 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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