Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chl1P70232 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chl1P70232 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chl1P70232 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chl1P70232 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chl1P70232 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chl1P70232 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chl1P70232 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chl1P70232 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chl1P70232 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chl1P70232 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chl1P70232 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chl1P70232 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chl1P70232 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chl1P70232 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chl1P70232 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms