Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps11P62281 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps11P62281 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms