Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps29P62274 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps29P62274 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rps29P62274 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms