Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ufm1P61961 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ufm1P61961 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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