Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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