Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SmoP56726 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SmoP56726 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmoP56726 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmoP56726 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmoP56726 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmoP56726 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmoP56726 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmoP56726 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmoP56726 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmoP56726 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmoP56726 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmoP56726 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmoP56726 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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