Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ClgnP52194 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms