Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FmodP50608 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FmodP50608 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FmodP50608 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms