Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkn1bP46414 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms