Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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