Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pabpc1P29341 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms