Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrkcdP28867 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms