Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U2af2P26369 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms