Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkchP23298 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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