Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxb9P20615 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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