Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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