Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms