Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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CcnkO88874 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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CcnkO88874 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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CcnkO88874 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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CcnkO88874 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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CcnkO88874 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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CcnkO88874 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CcnkO88874 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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