Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BlmO88700 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BlmO88700 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BlmO88700 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BlmO88700 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BlmO88700 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BlmO88700 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BlmO88700 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BlmO88700 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BlmO88700 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BlmO88700 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BlmO88700 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BlmO88700 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BlmO88700 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BlmO88700 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BlmO88700 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BlmO88700 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BlmO88700 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BlmO88700 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BlmO88700 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BlmO88700 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BlmO88700 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BlmO88700 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BlmO88700 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms