Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms