Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cavin1O54724 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cavin1O54724 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cavin1O54724 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms