Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
MttpO08601 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
MttpO08601 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
MttpO08601 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
MttpO08601 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
MttpO08601 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
MttpO08601 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
MttpO08601 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MttpO08601 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MttpO08601 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MttpO08601 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MttpO08601 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MttpO08601 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MttpO08601 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
MttpO08601 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MttpO08601 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MttpO08601 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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