Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm2888K7N746 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms