Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pot1bH7BX60 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pot1bH7BX60 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pot1bH7BX60 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pot1bH7BX60 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pot1bH7BX60 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pot1bH7BX60 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pot1bH7BX60 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms