Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r58G3X9U3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms