Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms