Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms