Protein–RNA interactions for Protein: D3YWW5

Rtl10, Retrotransposon Gag-like 10, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl10D3YWW5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rtl10D3YWW5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rtl10D3YWW5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms