Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm17333C6EQI3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Gm17333C6EQI3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm17333C6EQI3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm17333C6EQI3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm17333C6EQI3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm17333C6EQI3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm17333C6EQI3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms