Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Clip3B9EHT4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clip3B9EHT4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms