Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms