Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms