Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms