Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Prrt4B2RU40 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt4B2RU40 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms