Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms