Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf1B2RRD7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms