Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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