Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms