Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms