Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms