Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 4931417E11Rik-201ENSMUST00000070163 1095 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms