Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms