Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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