Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdac6Q9Z2V5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms