Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mrpl40Q9Z2Q5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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