Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf4Q9QZS2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf4Q9QZS2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms